三峡大学高水平足球队成立于2005年，球队曾在2007、2008和2009连续三年蝉联李宁杯中国大学生足球联赛冠军，成为继北京理工大学足球队后第二支在该项赛事中获得三连冠的队伍，三峡大学高水平足球队的名声由此传遍湖北乃至全国。
2009年，学校积极探索新的办队模式，与浙江省体育局下属单位黄龙体育中心商谈合作，共建职业化的球队，正式转型室内五人制足球。2010年，双方签订五人制足球战略合作协议，组建浙江黄龙——三峡大学足球俱乐部。至此，“校企合作”开启了三峡大学足球的新篇章。
合作三年来，俱乐部多次获得“中国足协室内五人制足球甲级联赛”（现为中国足协室内五人制足球超级联赛）亚军、季军和足协杯亚军等佳绩，先后为五人制国家队输送了10名队员，并于2011年代表中国参加亚洲五人制足球俱乐部杯赛。学校招收俱乐部优秀运动员6人到我校就读，同时也为俱乐部输送优秀球员11人，俱乐部成为国内最具实力、最为规范的五人制足球俱乐部之一，其运行模式得到国内体育界和社会的肯定。2013年，因浙江省事业单位经费运行机制发生了重大变化，双方合作终止。
为了进一步推广、发展五人制足球，2013年，学校又与武汉地龙实业集团签订了合作协议至今，成立了三峡大学——武汉地龙五人制足球队，这也是宜昌市第一支职业体育俱乐部！
自合作以来，大学生五人制足球队的竞技水平稳步提升，队员能力不断攀升，球队培养了一大批活跃在五超、五甲联赛的优秀球员，20余名运动员获得国家级健将称号，并先后为中国五人制国家队培养了18名国脚。大学生五人制足球队先后获得“中国大学生五人制足球联赛”湖北赛区冠军、2018西南赛区亚军、2019北区冠军、2023南区亚军、2023总决赛第5名在内的一系列佳绩，并代表中国大学生参加2016世界大学生五人制足球锦标赛，2017年代表湖北省参加第十三届全国运动会“笼式足球”的比赛。
在培养运动员的同时，球队也为各级国家队输送优秀教练员，王玮老师现担任中国五人制足球国家队助理教练，吕彬彬老师现担任中国五人制足球U20国家队守门员教练。两位教练员优异的工作得到了中国足协的高度认可，专程给学校发来感谢信。
▲2014中国足球协会杯五人制足球联赛冠军
▲足球队代表中国参加巴西
▲2019中国大学生五人制足球联赛（北区）冠军
▲2023中国大学生五人制足球联赛（湖北赛区）亚军
▲2023中国大学生五人制足球联赛（南区）亚军
▲2023中国大学生五人制足球联赛(总决赛）第五名
